Key Animation
2199 AD. Yamato tried to leave behind the Large Magellanic Cloud galaxy, after receiving a "Cosmo Reverse System" at its destination, Iscandar. However, suddenly, it encounters a mysterious group at the edge of the Large Magellanic Cloud. The crew finds out that the group is called the "Gatlantis," and that its leader is the Gutaba expeditionary force commander who calls himself "Goran Dagaamu of Thunder." The commander demands that Yamato be handed over to him. Yamato, wanting to hurry to Earth, escapes the fray. However, Yamato is attacked by a devastating beam weapon called the "Flame Direct Attack Cannon" that can transcend space.
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La acción transcurre en un plano temporal futurista, en el año 2144 aproximadamente, donde la Tierra ha sido devastada por unos seres llamados Festum desde el año 2114. Por ciertos eventos causados por estos seres los japoneses perdieron su fertilidad y fueron prácticamente borrados del mapa. Los supervivientes se encuentran ahora en una remota isla japonesa llamada Tatsumiya. La gente ha logrado sobrevivir escondiéndose de los Festums usando la más avanzada tecnología. Es el último paraíso en la Tierra. Lo más sorprendente de esta isla es que es todo un continente flotante. Al fin, los Festums descubren la isla y comienzan a atacar. Aún así, los humanos no estaban desprevenidos. Tras activar los escudos de energía que protegen la isla, mandan a un joven piloto, Kazuki Makabe (???? Makabe Kazuki), a luchar contra los Festums usando un robot gigante llamado Fafner.
