Kazuhisa Nakamura

かつて世界を滅ぼしかけ、四百年を過ぎた今なお人々にとっての 恐怖の対象であり、忌み嫌われ続ける存在である《嫉妬の魔女》。 伝説によれば、彼女は紫紺の瞳を持つ銀髪のハーフエルフであったという。 雪と氷に覆われたエリオール大森林に、たった一人で暮らすエミリアは、 嫉妬の魔女に瓜二つという理由から、魔女と恐れられていた。 誤解され、傷つき、それでも小さな希望を持って、孤独を生きていた エミリアの前に現れたのは、小さな猫の姿をした精霊だった。

呪いの元凶である魔獣ウルガルムを打ち倒し、 アーラム村の子供たちを救ったスバルたち。 やっと訪れた平穏も束の間、スバルは 誰にも知られてはならない、とある極秘ミッションに挑んでいた。 しかし変装していたにも関わらず、すぐにペトラを始め、 村の子供たちに正体がバレてしまうスバル。 開始5秒でバレてしまったミッションとは、 エミリアとのデートコースの下見で……。

徳川幕府の終わりが宣言され、徳川慶喜が大阪へと下ったことで、新選組も戦いに備えて伏見奉行所へ屯所を移すことになる。そして慶応3年、新選組隊士の市村鉄之助は、かねて親しくしていた少女・沙夜への思いを抱きながらも、副長・土方歳三の小姓として、隊医で親友の山崎烝、兄の辰之助らと新選組として運命を共にしようとするだが……。

シュタインズゲートに到達してから1年後、まゆりも紅莉栖も死なない世界で、岡部は別の世界線では敵だった天王寺や萌郁とも良好な関係を築き、平穏ながらも幸せな日々を満喫していた。そんな中、アメリカの研究所にいた紅莉栖が、仕事を理由に1年ぶり秋葉原へと帰って来る。久しぶりの再会に喜びを分かち合う中、岡部は激しい頭痛に襲われ、次々に脳裏に浮かぶ別の世界線での記憶によって頭をかき乱される。 岡部は、過去の数限りない歴史改変とリーディングシュタイナー発動の代償として、R世界線にとばされることになる。時間跳躍のもたらす苦悩を知り抜いていた岡部は、過去改変を厳しく禁じていた。しかし、ダルやまゆりですら岡部の存在を忘れ、さらに紅莉栖自身も彼の記憶が薄れてしまった世界線で、紅莉栖は「何かこの世界に足りないもの」を取り戻すために、タイムリープに挑む。

オレンジ諸島の旅を続けるサトシたちの船が突然の嵐で流され、アーシア島に漂流する。お祭りで賑わうその島で、サトシは島の少女・フルーラに祭りの行事である"すぐれたあやつり人"の役目をおわされた。その頃、世界中の珍しい物を集める謎のコレクター、ジラルダンが、海の神と呼ばれる幻のポケモン、ルギアを手に入れようと画策していた・・・