Looking at Miyuki and Tatsuya now, it might be hard to imagine them as anything other than loving siblings. But it wasn't always this way - Three years ago, Miyuki was always uncomfortable around her older brother. The rest of their family treated him no better than a lowly servant, even though he was the perfect Guardian, watching over Miyuki while she lived a normal middle school life. But what really bothered her was that he never showed any emotions or thoughts of his own. However, when danger comes calling during a fateful trip to Okinawa, their relationship as brother and sister will change forever.
바닷가 마을에 있는 낡은 한 채의 ‘집’을 무대로 두 여성의 이야기가 평행하게 그려진다. 한쪽에 있는 사람은, 아버지가 실종된 뒤 어머니와 둘이 살아가는 열네 살의 세리. 또 다른 한쪽은 페리 위에서 기억을 상실한 자신을 발견한 사나. 두 사람은 대체 어떤 관계에 있는 것일까? 둘은 교차하지 않는 평행 세계에 있는 듯도 하지만, 낡아빠진 셔터, 계단, 창문에 드리운 반투명의 천, 유리 꽃병. 그러한 매혹적인 오브제가 이른바 개구부(開口部)가 되어 ‘저쪽’과 ‘이쪽’은 반전되기 시작한다.
이라고 불리는 세계 규모의 혼돈에서 되살아 난 세계. 과거에 일어난 의 반동으로 세계는 극단적인 건강지향과 사회의 조화를 중요시하고 초고도 의료 사회로 변화한다. 그런 다정함과 자애로 가득 찬 가짜 세계에 맞서는 방법을 매일 생각하고 있는 소녀가 있다. 소녀의 이름은 미히에 미아. 세계를 향한 저항을 표하기 위해 그녀는 자신의 카리스마에 끌린 두 명의 소녀와 함께 어느 날 자살을 한다. 13년 후, 키리에 투안은 너무 상냥한 일본 사회가 싫어 전장의 평화 유지 활동을 최전선에서 펼치고 있었다. 키리에 투안은 과거 자살 사건에서 살아 남은 소녀. 평화에 너무 익숙해진 세계를 향해 어떤 범행 그룹이 수 천명 규모의 목숨을 뺏는 사건을 일으킨다. 범행 그룹으로부터 세계를 향해 보내진 “선언”에 따라 세계는 다시 공포에 떨어지게 된다. 키리에 투안은 그 선언에서 죽은 것인 분명한 미아의 숨결을 느낀다. 투안은 과거 같이 죽으려고 했던 미아의 존재를 확인하기 위해 일어선다.
모든 것이 네트워크로 연결된 미래 도시, 군사독재정권 시아크 공화국의 테러리스트 13인이 자살하는 사건이 벌어진다. ‘공각기동대’로 불리는 공안 9과는 이 연쇄 자살을 ‘전뇌 해킹’을 통한 동일 사건으로 판단하고, 사건의 열쇠를 쥔 해커 ‘꼭두각시 조정자’를 찾아 나선다. 하지만 제1의 용의자로 지목된 시아크 공화국의 독재자 ‘카루마 장군’이 싸늘한 주검으로 발견되고 사건은 점차 미궁 속으로 빠져든다. 그러던 중, 2년 전 행방불명 됐었던 전 멤버 ‘쿠사나기 모토코’가 제2의 용의자로 지목되고, 리더 ‘토구사’의 딸이 납치당하는 등 ‘공각기동대’의 절체절명 위기가 닥쳐오는데…
The future earth where cities have been buried due to global warming and the environment important for humankind and life has been destroyed. One day, Kai, the hero who lives lonely without any friends to interact with, is led by the "Phoenix" and descends into the desert area of the modern earth. What fate awaits Kai when he meets a girl there...