러시아 밀매꾼들은 새로운 에너지원인 적색 수은을 찾던 도중 극비 무기인 콜로서스를 실수로 작동시킨다. 콜로서스는 냉전시대 제작된 거대 로봇으로 지구의 종말을 불러올 수 있을 만큼 놀라울 정도로 파괴력이 강력한 무기다. 한편 바다에서는 거대 상어인 메가 샤크가 출현하여 선박을 파괴하고 해안가 주민들을 위협하자 피해가 커질 것을 우려한 해군은 메가 샤크 전멸 작전을 실시한다. 엄청난 괴력의 거대 상어 메가 샤크에 함대까지 속수무책으로 당하자 콜로서스의 힘을 빌리면서 지상 최대의 해상전투가 시작된다.
지진으로 인한 방사능 유출로 마비된 12구역은 갱단들의 은신처가 되고, 정부에서는 12구역 소탕작전을 계획한다. 한편 하몬드 경관은 새 파트너로 인간의 모습을 한 로봇인 안드로이드 캅을 맞이하게 되지만, 첫 만남부터가 순탄하지 않다. 사사건건 부딪히던 그들은 시장의 개인적 요청으로 다시금 12구역으로 들어가게 되고, 그 구역이 격리된 숨겨진 원인을 알게 되는데...
