쿠누기가오카 중학교 최악의 반 3-E반에 정체불명의 문어 모양의 괴물이 담임선생님이라며 나타났다. 정부는 E반 학생들에게 3월에 세계를 파괴하겠다고 협박하는 일명 '살생님'이라는 괴물을 암살하라는 비밀 지령을 내린다. 성공하는 사람에게 주어지는 현상금은 놀랍게도 1,000억원! 학생들은 졸업 전에 그 미션을 성공할 수 있을까? 그리고 '살생님'의 진짜 목적은 무엇일까?
작은 공장에서 일하며 친구라곤 없이 외롭게 살고 있는 요지는 강 건너 공장에서 일하는 사치코와 점차 사랑에 빠진다. 한편 지구 곳곳에서 알 수 없는 기묘한 생물체들이 사람들에게 기생, 그들의 정신을 지배하여 소위 ‘네크로보그’라는 괴물을 만들어내고 이들 ‘네크로보그’는 생존을 위해 서로를 살육하기 시작한다.