시골에 사는 소녀 미츠하(가미시라이시 모네)는 어느 날 잠에서 깬 후 자신의 몸이 남자로 바뀐 걸 알게 된다. 같은 시간, 도쿄에 사는 소년 타키(가미키 류노스케) 역시 이 기이한 상황을 겪고 있다. 낯선 가족, 낯선 친구들, 낯선 풍경들... 서로에게 이어진 끈을 알게 된 둘은 둘만의 규칙을 정하고 점차 상황을 받아들이기 시작한다. 서로에게 남긴 메모를 확인하며 점점 친구가 되어가는 타키와 미츠하. 언제부턴가 더 이상 몸이 바뀌지 않자 자신들이 특별하게 이어져있었음을 깨달은 타키는 미츠하를 만나러 가는데...
Class 3-E is getting ready for their class trip to Kyoto, and Koro-sensei is as excited as ever! Nagisa is in a group with Kaede, Karma, Tomohito, Manami, and the class idol Yukiko Kanzaki. The students are aware of the fact that this is a great opportunity to assassinate Koro-sensei, but they cannot help having great time with him. However, the trip becomes even more exciting and dangerous when they get attacked by a bunch of delinquents who kidnap the girls. As if that is not enough, there is a hired sniper named Red Eye lurking around, ready to be the one who would assassinate Koro-sensei and claim the prize. Can the students of Class 3-E rely on Koro-sensei even now?
