Set in Y-Academy, an elite school that only allows students with top class abilities to enter. The protagonist, Jinpei Jiba, and his unique friends take on the mysteries of the school as transforming heroes.
Lupin está atrás do tesouro mais precioso do chefe da máfia Galvez: o Clam of Helmeth, um cilindro verde feito de metal inquebrável, guardado pelo pistoleiro Jigen. Também purista do Clam está um colega ladrão chamado Brad e seu parceiro, Fujiko. Enquanto isso, o inspetor Zenigata, emparelhado com um detetive americano, foi despachado pela polícia japonesa para caçar e prender Fujiko. Do outro lado do mundo, o samurai Goemon procura uma espada digna de suas habilidades: uma que esteja misteriosamente conectada ao tesouro no cofre de Galvez. Em breve, cada grupo estará reunido em uma aventura épica que conta como a gangue Lupin se conheceu!