Isabella, a filha da nobre família York, está matriculada em uma escola só para garotas para tornar-se uma dama digna de nobreza. No entanto, ela desistiu do seu futuro, vendo a prestigiosa escola como nada mais do que uma prisão do mundo exterior. Sua família nota sua dificuldade em suas aulas e decide contratar Violet Evergarden para lhe dar aulas pessoais.
A história desenrola-se num mundo pós apocalíptico e segue Patema, uma princesa que gosta de explorar as zonas perigosas e proibidas da sua vila. Nunca ninguém lhe explicou porque aquelas zonas eram proibidas até um dia em que ela se depara com algo pouco usual.
