O filme conta a história de Suzu, uma garota de 18 anos que se muda para Kure, uma cidade militar próxima de Hiroshima. Como conta a história, Hiroshima é aniquilada no dia 6 de agosto de 1945. Sede de uma importante base da marinha, Kure experimenta seus próprios demônios: de bombardeios incendiários a voleios de artilharia. Além de experimentar diversas situações conflitantes ao seu redor, Suzu deve se tornar forte o suficiente para viver longe de sua família e conviver com a família de seu noivo.
Após ter sido acusado pela tentativa de assassinato do Raikage, e ter matado dois Jounins, Naruto é mandado para o Houzukijou, uma Prisão de Segurança Máxima, mais conhecida como Blood Prison (A Prisão de Sangue). O Diretor dessa Prisão, Mui, utiliza um jutsu supremo de confinamento, selando os poderes de todos os seus prisioneiros. Começa então a batalha para provar a inocência de Naruto e expor os segredos por de trás da Blood Prison.
É um resumo da ultima parte do anime, entre os episódios 26 e 37, mostrando a nova batalha de Kira contra os dois aprendizes de L, Mello e Near. E também são apresentadas cenas detalhadas, partes censuradas e cortadas do anime.
Entre os cinco grandes países de shinobi, os países da Água, Terra, Trovão e Vento estão perdendo seus Kekkei Genkai, um atrás do outro. O único que não foi afetado foi o País de Fogo, os outros começam a suspeitar que isto não é nenhuma coincidência. Embora a tensão da situação pode levar a uma nova Guerra Shinobi, Kakashi desaparece da aldeia, qual será o motivo...!? Entretanto os 11 de konoha vão por vontade própria em busca de Kakashi acabando por enfrentar o bando de shinobis desconhecidos... como correrá?
Harada Kusuko é uma garota do ensino médio com uma paixão secreta pelo playboy da classe, Mishima Takeshi, porém, com a rotação constante de meninas em seus braços, ela mantém uma distância segura. Mishima assume sua atitude de frieza e a confronta sobre isso. No entanto, eles conseguem superar os mal-entendidos e até começam a namorar. Quanto mais ela o conhece, mais ela se pega se apaixonando, mas um dia, ela ouve ele falando com outra garota no telefone...
