A agência cripto-zoológica Monarch enfrenta uma quantidade de monstros de proporções inimagináveis, incluindo o poderoso Godzilla. O réptil gigantesco irá colidir com Mothra, Rodan e o maior e mais poderoso inimigo de todos – o rei Ghidorah de três cabeças.
A jovem Bianca (Mae Whitman) descobre um dia que foi escolhidas pelas amigas de colégio como uma DUFF (Designated Ugly Fat Friend), ou seja uma amiga feia para que elas se pareçam ainda mais bonitas em comparação. Revoltada, Bianca pede a um atleta popular da escola para ajudá-la a melhorar o seu visual.
Um grupo de jovens acaba descobrindo instruções secretas para montar uma máquina do tempo, e decidem construir o aparelho. No entanto, os efeitos são muito diferentes do que esperavam.
