Seguindo seu sonho, JP, o Suave, torna-se um piloto e ganha fama e fãs por causa de seu estilo retro, bem como os acidentes frequentes e espetaculares que se envolve devido as corridas que participa. JP fora preso, no passado, por participar de corridas arranjadas, cujo agiota ainda tenta coagir a ele e seu mecânico - Fresbee -, e pagar para que percam corridas no circuito. Durante a etapa de qualificação chamada Linha Amarela, o motor de JP explode, e à beira de desistir, ele descobre que, por votação popular, qualificou-se para a corrida sem regras chamada Linha Vermelha depois que dois outros motoristas desistiram. A razão por trás disso é que o governo do Robômundo, o planeta militar onde acontecerá a corrida final, se opõe ao evento e ameaça todos os participantes. Neste meio tempo, JP envolve-se com Sonoshee McLaren, também corredora e antigo amor platônico dele, e conhece Trava e Shinkai, dois ex-militares do Robômundo que agora são piratas intergalácticos com seu Speedmaster.
Continuando de onde o último filme ("Evangelion 1.11: Você (Não) Está Só") parou, o filme começa com uma nova criança, Mari Illustrious Makinami, que pilota a Unidade 05 para destruir o Terceiro Anjo que ataca a base ártica da NERV.
