Kabamaru é um menino criado e treinado como ninja por seu avô. Após a morte repentina de seu avô, ele passa a viver com Mai, a amante de seu avô, que é diretora de escola. Ele é convidado a ajudar nas lutas contra outras escolas, já que é mestre nas artes místicas ninja. Com o passar do tempo, ele fará muitos amigos, além de inimigos, e se apaixonará por Mai.
