O inspetor Zenigata é preso e a imprensa afirma que ele foi o verdadeiro mentor de todos os notórios assaltos de Lupin! Não demora muito para que o orgulho de Lupin leve a melhor sobre ele, e o rico magnata Roy Forest o manipula para aceitar um novo desafio: roubar o "Cristal do Tempo" em uma semana. O Time Crystal é um segredo do governo que se tornou público: um mecanismo de supercomputador que pode descriptografar senhas seguras mais rápido do que jamais imaginou ser possível. Mas por que Jigen está agindo tão estranhamente ultimamente? O que aconteceu com o jovem prodígio do piano que foi recentemente sequestrado? E qual é a estranha conexão entre todos eles?
Um jovem Goemon é contratado como guarda-costas para salvar a cabeça da família Yakuza de Steel Dragons contra uma máfia rival. Depois de impedi-lo de ser atingido por uma bala em seu barco de apostas de luxo, uma enorme explosão termina a vida do patrão; Foi causado por um homem misterioso, armado com dois machados. Enfurecido, Goemon tenta ir atrás dele, mas o homem consegue escapar em um dos barcos de resgate do barco. Lupin, Jigen e Fujiko, que estavam prestes a deixar o navio depois de roubar uma sala cheia de dinheiro, testemunhar a cena e Fujiko reconhece o homem misterioso, que não é nada mais e nada menos do que Hawk, também conhecido como "o fantasma das Bermudas". A lenda diz que ele matou um exército de 2000 homens sozinhos, mas supostamente, foi confirmado morto por 20 anos. Por que ele está vivo, e por que ele está no Japão? O Inspetor Zenigata segue os passos de Hawk para capturá-lo, bem como Goemon, que procurará vingar a morte de seu chefe para restaurar sua honra.
Aron pede a ajuda de Doraemon e Nobita para salvar seu planeta, o planeta Pokkuru. Chegando lá, a turma percebe que não está em um filme e que estão lutando contra vilões de verdade.
