A Quinta Guerra do Santo Graal na cidade de Fuyuki atingiu um ponto de inflexão em que as vidas de todos os participantes são ameaçadas enquanto o inimigo oculto finalmente se revela. Enquanto Shirou Emiya, Rin Toosaka e Illyasviel von Einzbern descobrem a verdadeira natureza corruptora da sombra que está assolando a cidade, eles percebem o quão terrível é a situação. Para proteger seus entes queridos, o grupo deve resistir à força inimiga aparentemente intransponível - mesmo que alguns desses inimigos já tenham sido seus aliados, ou talvez, algo mais íntimo. Quando o ato final dessa guerra caótica começa, os ideais que Shirou acredita serão em breve desafiados por um dilema excruciante: é realmente possível salvar um mundo onde tudo parece ter dado errado?
Third-grader Himeno moves to a huge mansion in the country. However, she soon finds out it's a ninja house! The ninjas Akamaki, Aomaki, and Kiiromaki mistake Himeno for a princess and begin solving problems for her with their own unique skills. But that is not the full extent of their powers! When Aomaki and Kiiromaki combine, they form Midorimaki. Similarly, when Akamaki and Aomaki combine, they form Murasakimaki; and when Akamaki and Kiiromaki combine, they form Daidaimaki. Life with these colorful ninjas has only begun when they discover a large tornado heading for the mansion. What will happen to Himeno's family? Can the colorful ninjas protect Himeno?
