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Many engineers from around the world gather at the Interpol marine facility "Pacific Buoy" on Hachijo-jima, in the sea south of central Tokyo Prefecture coast, to witness the launch of a new system that connects all law enforcement camera systems around the world and enables facial recognition worldwide. Conan, along with his friends Kogoro, Ran, Agasa, Haibara, and the Detective Boys, also heads to the island with an invitation from Sonoko to see the whales. He receives a message from Subaru, who says that a Europol agent has been murdered in Germany by Gin. Perturbed, Conan sneaks onto the police ship led by Kuroda, which is bringing them to the island to protect the completion work, and tours the new facility, just in time for the Black Organization to kidnap a female engineer, seeking a piece of important data in her USB drive. A terrifying howl of screws is heard from the ocean as an unknown person approaches Haibara.
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Shibuya, Tóquio, está agitada com a temporada de Halloween. Um casamento está sendo realizado em Shibuya Hikarie, onde a detetive Miwako Sato, do Departamento de Polícia Metropolitana, está vestida com um vestido de noiva. Enquanto Conan e os outros convidados assistem, um agressor aparece de repente e o detetive Wataru Takagi, que estava tentando proteger Sato, fica ferido. Takagi sobreviveu e a situação foi resolvida, mas aos olhos de Sato, a imagem do ceifador que ela viu quando o detetive Matsuda, o homem por quem ela estava apaixonada, foi morto em uma série de atentados há três anos, coincidiu com Do Takagi.
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O jovem Yuta Okkotsu ganha o controle de um espírito extremamente poderoso, então um grupo de feiticeiros o matriculam na Tokyo Prefectural Jujutsu High School, para ajudá-lo a controlar esse poder e também para ficar de olho nele.
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O jovem Yuta Okkotsu ganha o controle de um espírito extremamente poderoso, então um grupo de feiticeiros o matriculam na Tokyo Prefectural Jujutsu High School, para ajudá-lo a controlar esse poder e também para ficar de olho nele.
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Ruka é uma jovem garota cujos pais são separados e cujo pai trabalha em um aquário. Quando dois meninos, Umi e Sora, que foram criados no mar por dugongos, são levados ao aquário, Ruka se sente atraída por eles e começa a perceber que ela tem o mesmo tipo de conexão sobrenatural com o oceano que eles. O poder especial de Umi e Sora parece estar conectado a eventos estranhos que ocorrem cada vez mais frequentemente, como o aparecimento de criaturas marinhas longe de seu território e o desaparecimento de animais de aquário em todo o mundo. No entanto, a natureza exata do poder dos meninos e dos eventos anormais é desconhecida, e Ruka é atraída para investigar o mistério que cerca seus novos amigos.
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A história começa numa aula de música quando, durante o ensaio do coral para o festival escolar, Hikaru Kusakabe percebe que o estudante de honra da escola, Rihito Sajō, não está cantando. De início, ele pensa que o estudante simplesmente não gosta de cantar, até encontrar Rihito ensaiando numa sala vazia na escola. Sem pensar duas vezes, Kusakabe decide ajudar o colega a ensaiar o canto.
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Dual e Dorothy são dois antivírus que cuidam para que nenhum problema aconteça no sistema. Elas escaneiam diversos mundos paralelos, que na verdade são backups do nosso mundo, e deletam os mundos que estiverem contaminados. Certo dia, uma menina aparece no mundo virtual delas. Quem é essa menina? O que ela faz ali? Ela é um programa, como Dual e Dorothy, ou uma humana? Juntas, as três meninas embarcam pelos diversos mundos de backup a procura de respostas e, pela primeira vez, Dual e Dorothy questionam a própria existência.
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Prequel to the TV anime series, revolving around the "origin of the dream."
