A história de Suzume, uma garota japonesa de 17 anos, que conhece um jovem rapaz procurando por uma "porta". Os dois viajam juntos e a encontram dentro de algumas ruínas numa montanha e cercada por água em seu redor, como se tivesse ocorrido algum desastre e ela fora o único objeto restante. Suzume a abre e então, as "Portas do Desastre" começam a se abrir ao redor do Japão, uma após a outra, trazendo desastres intermináveis.
A história de Nikuko e Kikuko, uma mãe solteira e sua filha de 11 anos que vivem suas vidas como podem. Descontraída, alegre, apaixonada e sempre pronta para comer algo delicioso, a mãe Nikuko leva consigo seu lema: “O simples é tudo!” Seu jeito alegre e ousado acaba deixando sua filha Kikuko, à beira da puberdade, em situações constrangedoras. Sem ter nada em comum, exceto viverem juntas em um barco no porto, as coisas começam a mudar quando um grande segredo é revelado.
Nobita accidentally found a fossil dinosaur egg mixed with rocks in the dinosaur fossil exhibition site that he had visited before. He returned it to its original state with the "Time blanket". After hatching, the egg hatches a new species of dinosaur that is not named in the Cosmic Encyclopedia and names them Kyu and Myu Although they want to take care of them secretly, there are dinosaurs in the city still discovered by residents; Nobita and his friends were forced to bring them back to the Cretaceous period 66 million years ago the dinosaurs time. Just the time of Dinosaurs Extinction.
A história se concentra no relacionamento entre Hinako, que se mudou para uma cidade costeira ao entrar na universidade e Minato, um jovem bombeiro com um forte senso de justiça. Hinako adora surfar e, apesar de destemida no mar, ainda está incerta sobre seu futuro. Após um acidente de incêndio na cidade, Hinako e Minato se encontram. À medida que passam mais tempo surfando juntos, Hinako se sente atraído por Minato, que se dedica a ajudar os outros.
Ruka é uma jovem garota cujos pais são separados e cujo pai trabalha em um aquário. Quando dois meninos, Umi e Sora, que foram criados no mar por dugongos, são levados ao aquário, Ruka se sente atraída por eles e começa a perceber que ela tem o mesmo tipo de conexão sobrenatural com o oceano que eles. O poder especial de Umi e Sora parece estar conectado a eventos estranhos que ocorrem cada vez mais frequentemente, como o aparecimento de criaturas marinhas longe de seu território e o desaparecimento de animais de aquário em todo o mundo. No entanto, a natureza exata do poder dos meninos e dos eventos anormais é desconhecida, e Ruka é atraída para investigar o mistério que cerca seus novos amigos.