Shadow Galactica, uma nova força inimiga liderada por Sailor Galaxia, tem como alvo as Sailor Guardiãs, acabando com a paz que elas conquistaram, e ameaça destruir as guardiãs. Usagi vai lutar com todas as forças para enfrentar a poderosa Sailor Galaxia. A última batalha da guerreira do amor e da justiça, está prestes a começar.
A nova aventura acontece em abril, quando as cerejeiras florescem e Tóquio está em festa, celebrando o maior eclipse solar do século. A lua nova começa a tapar o sol, reduzindo gradualmente sua luz. Usagi e Chibi-Usa encontram Pegasus, que procura a donzela escolhida, capaz de romper o selo do Cristal Dourado. Enquanto isso, um misterioso grupo chamado Dead Moon Circus aparece na cidade, com o plano nefasto de espalhar pesadelos conhecidos como Lemures pelo mundo para roubar o domínio do Cristal de Prata sobre a lua e a Terra e, por fim, conquistar o universo todo.
Kiyomaro foi raptado por um grande objeto, e ele perdeu a sua consciência a caminho. Quando voltou a si, ele estava em um castelo rodeado de máquinas. Então, um monstro chamado Doutor M2 apareceu. Doctor M2 disse a Kiyomaro se tornar parceiro dele para conquistar o mundo mágico.