Key Animation
O filme se passa um ano depois dos eventos na série de TV. Depois de passar por uma jornada meticulosa através de várias “Linhas de Mundo” devido à invenção do “D-Mail”, Okabe Rintarou finalmente chegou à linha de mundo de “Steins Gate”, onde nenhum de seus amigos morreram e o futuro dominado pela SERN não existe. No entanto, logo Rintarou começa a sentir os efeitos colaterais de suas viagens através de várias linhas de mundo, e isso leva ao desaparecimento de sua existência. Como apenas Makise Kurisu se lembra dele através de um déjà vu, cabe à ela encontrar uma maneira de trazer Rintarou de volta.
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Uma batalha cibernética de ficção científica. Em 2022, a tecnologia da computação quântica já está muito avançada, e muitas pessoas transferem suas mentes para o espaço cibernético. A irmã mais nova de Remu, Shiki,confessou a seu irmão através do Skype que ela estava falando diretamente do espaço cibernético, e seu corpo real tinha sido mantido em um tanque de água cheio de meios de cultura. Isto é chamado de “Body Pool”, e Shiki conectou à rede por nanomáquinas implantadas em seu cérebro. Remu ficou surpreso, mas aceitou sua decisão até que o acidente chamado “Early Rupture” aconteceu. O servidor de rede ficou sobrecarregado, e as mentes dos usuários foram perdidos no espaço cibernético deixando os corpos vivos sem alma nas “Piscinas de Corpos (Body Pool)”. A fim de trazer a mente (alma) de Shiki de volta, Remu visita seu apartamento na OMFC, e lá ele encontra Shiki, que fugiu do hospital.
