Shadow Galactica, uma nova força inimiga liderada por Sailor Galaxia, tem como alvo as Sailor Guardiãs, acabando com a paz que elas conquistaram, e ameaça destruir as guardiãs. Usagi vai lutar com todas as forças para enfrentar a poderosa Sailor Galaxia. A última batalha da guerreira do amor e da justiça, está prestes a começar.
A história do novo filme se passa na Floresta Okoya, um paraíso Pokémon protegido por leis estritas que proíbem visitantes de pisar na área. O filme é centrado em Coco, um menino que foi criado por Pokémon e também se considera um, tratando o Pokémon Mítico Zarude como seu pai. Ash e Pikachu encontram Coco durante uma aventura.
Shun Hashimoto é um aspirante a romancista abertamente gay que vive em Okinawa e foi abandonado por seus pais depois de se assumir para eles. Mio Chibana é um estudante do ensino médio órfão e reservado, muitas vezes encontrado passando seu tempo à beira-mar. Um dia, os dois se encontram na praia, e Shun é instantaneamente cativado por Mio. Os dias voam enquanto eles lentamente começam a se aproximar até que Mio de repente anuncia que ele tem que partir para o continente. Três anos se passam antes que Mio, de 20 anos, retorne a Okinawa para confessar seu amor a Shun. No entanto, nesses três anos, a vida de Shun mudou. Ele será capaz de aceitar os sentimentos de Mio e assumir tal compromisso?
Ash Ketchum tem 10 anos, o que significa que ele já tem idade suficiente para se tornar um instrutor de Pokémon. Ash sonha muito sobre as aventuras que ele experimentará depois de ganhar seu primeiro Pokémon do Professor Oak.
A história segue um jovem professor universitário genial que é capaz de aprender qualquer idioma. Ele é solicitado a decifrar um código usado na comunicação sem fio: o Código Luger, desenvolvido por lobisomens, inimigos da humanidade. Assustado ao descobrir que não consegue decifrar o código e desesperado para estudá-lo, o professor embarca em uma jornada para capturar um lobisomem vivo para ajudá-lo.
Conforme Ash e seus amigos continuam sua jornada, Volcanion cai do céu na frente deles. O objetivo de Volcanion é recuperar Magearna, que foi sequestrada pelo "Reino Azoth", uma cidade de super máquinas. No entanto, Volcanion e Ash tornaram-se ligados entre si por um estranho cinto magnético. Será que os dois conseguirão trabalhar juntos e salvar Magearna?