Cuando la explosión de una fábrica hace que el tiempo se detenga en su pequeña ciudad, el joven Masamune y sus amigas se enfrentan a un mundo que se derrumba rápidamente.
La historia se centra en la niña de secundaria Nagisa Yukiai que vive en una ciudad costera. Ella ha creído la historia de su abuela de que los espíritus habitan en palabras y se les llama «kotodama» (espíritu de palabra). Un día, se pierde en una mini estación de FM que no se ha usado durante años. Como un impulso del momento, ella trata de hablar como un DJ usando la instalación. Pero su voz transmitida accidentalmente llega a alguien que nunca había esperado.
En esta película, y una vez más, el destino del mundo está en peligro, puesto que una organización de criminales se quiere hacer con tecnología secreta de S.H.I.E.L.D., que si cae en malas manos puede ser muy peligrosa. S.H.I.E.L.D. también está en peligro, puesto que lo primero que harían los terroristas sería eliminar esa unidad para tener el camino libre y llevar a cabo sus intenciones sin que nadie opusiese resistencia. Para evitar esto tanto de Punhiser como la Vida Negra van a tener que colaborar, aunque lo cierto es que el primero lo hace de mala gana y tras ser detenido al molestar a S.H.I.E.L.D. en una de sus investigaciones. Ambos van a hacer lo posible, bajo una enorme responsabilidad, pues la estabilidad del mundo que conocemos depende de ellos y de nadie más, puesto que ellos son los únicos con la capacidad necesaria para hacer que los terroristas no lleven a cabo su maligno plan.
