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En 1995, Mikiya Kokutō se encuentra brevemente con una chica llamada Shiki Ryōgi mientras caminaba hacia su casa. Más tarde, en su escuela secundaria, Mikiya reconoce a Shiki entre la multitud. Él se presenta a ella. Si bien Shiki aparentemente ha olvidado su reunión anterior y se comporta de manera significativamente diferente, los dos se hacen amigos. Algún tiempo después, por la noche, Shiki sale de su casa para pasear por la ciudad de Mifune. Encuentra el cadáver de una víctima de accidente de tráfico y aplica su sangre en sus labios, aparentemente en trance.
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Nota: los eventos de la película se presentan al espectador en formato no lineal. Esta sección describe los eventos en orden cronológico. En septiembre de 1998, la taciturna Shiki Ryōgi vive sola en un apartamento apenas amueblado donde suele visitarla un amigo cercano, Mikiya Kokutō. Un día, él la visita y le ofrece a Shiki helado Haagen-Dazs con sabor a fresa. Los dos se involucran en bromas amistosas. Más tarde, Shiki habla sobre una serie de suicidios que involucran a varias chicas de secundaria con el mago Tōko Aozaki, director de Garan no Dou (伽藍 の堂, Hollow Shrine), una agencia de detectives (de la cual Shiki y Mikiya son empleados) que se especializa en sucesos paranormales.