Sho Saito

ある日、東京湾に輸送機が墜落する。その後湾岸の各所で何者かによってレイバーが襲撃される事件が連続して発生。警視庁城南署の刑事、久住と秦は各所で聞き込み捜査を進め、墜落事件の後に巨大なハゼが釣れていた事、墜落した輸送機の貨物コンテナに不審な点があることなどの奇妙で不審な点を突き止める。 その後、6月8日の雨の夜に若者の集うディスコクラブ「バビロン」で車に乗ったカップルの惨殺死体が発見される。時を同じくして近隣にあるバビロン工区の水上コンテナ備蓄基地で突如警報が作動し、停電と共に内部の職員と連絡がとれなくなる、という事態が発生。 近くを走行中のパトカー（城南4）に偶然乗っていた久住と秦は、警備員の通報を受けパトカーに乗る警官らと共に現場に急行。施設内部へと分け入る。しかし、そこで彼らが遭遇したのは廃棄物13号（WXIII）と名付けられた異形の怪物だった。

The film begins with some Polaroids of a young boy and a young girl. A female voice over tells us who these people are...they are brother and sister, she is seven and he is eight. She goes on to say that when she was seven and he was eight, she told her brother that she would marry him.

不可侵条約を結んでいた山の国パロの手先によって、海辺の国イサは水門を開かれて水没しかかる。だがイサのサキの村には良い思い出だけを残すという不思議な“ウインダリア”の木があった。サキの村の若者イズーによって国は救われるが、やがて彼は愛する妻マリーを残してパロへ旅立つ。