언제나 사이좋은 하나, 히나타, 노아, 코요리, 카논은 오늘도 미야코가 만든 수제 과자 앞에 옹기종기 모여 앉아 과자 파티를 한다. 과자 중에는 하나가 꽂은 머리핀과 똑같이 생긴 꽃모양 쿠키가 있었다. 그 머리핀은 하나가 어렸을 때 외할머니에게 받은 소중한 보물로 아이들은 하나와 외할머니 이야기를 흥미진진하게 듣는다. 그러다가 문득 수학여행 연습도 할 겸 하나네 외할머니 댁에 놀러 가기로 하는데...
전 세계 개성 보유자 섬멸을 목표로 하는 수수께끼 조직 휴머라이즈. 그들이 각국에 설치한 '이디오 트리거 밤'으로부터 사람들을 구하기 위해 세계 선발 히어로 팀이 결성된다! 세계 각국의 프로 히어로와 유에이 고교 히어로과 학생들이 소집되어 각 지역에서 폭탄 회수 임무를 맡게 되는데... 엔데버 사무소에서 인턴 중인 미도리야, 바쿠고, 토도로키는 오세온에서 작전 수행 중, 어떠한 사건에 휘말리게 되고 미도리야는 이를 계기로 만난 운반책 소년 로디와 함께 경찰, 빌런의 공격을 받으며 전국에 지명수배된다. 한편, 휴머라이즈의 지도자 플렉트 턴이 범행을 예고하며 세계는 패닉에 빠지고, 히어로 팀은 절체절명의 상황에 위험을 무릅쓰고 폭탄 회수에 나서는데... 제한시간은 단 2시간! 전 세계와 히어로들의 미래가 '그들' 손에 달렸다!
대학 입학이 걸린 동계 무한궤도배 최종 우승팀은?! 대학 선발팀과의 시합에서 우승하며 오아라이 여고를 폐교 위기에서 구해낸 미호와 전차도 팀원들은 3학년 선배 모모의 유급 소식을 듣는다. 스포츠 특기생 전형으로 모모의 대학 진학을 돕기로 하고, 20년 만에 부활한 동계 대회 우승을 목표로 다시 한번 의기투합하는 오아라이 여고 전차도 팀. 모모를 대장으로 무한궤도배 토너먼트전에 출전하지만, 첫 경기부터 강호 BC자유 고교를 만나 예상치 못한 위기에 빠지게 되는데…
올해는 2025년이에요. 치명적인 테러공격으로 도쿄 올림픽이 중단된 지 5년이 지났습니다. 현재 유엔이 운영하는 국제학교는 도쿄만의 끝에 있는 과거의 올림픽 회장에 있습니다. '꽃'이라고 불리는 특별한 능력을 가진 7명의 틴에이저가 학생들 가운데 있습니다. 이 학생들의 정체는 유엔이 운영하는 첩보기관의 멤버로서의 학생 신분은 그들의 진짜 정체의 커버에 불과합니다. 그들의 목적은 같은 능력을 가진 다른 십대들을 암살하는 것입니다. 꽃은 반드시 임무를 수행할 수밖에 없습니다. 그들의 조직은 이를 확실히 하기 위해 가족을 인질로 잡고 있습니다. 꽃에게 있어 실패는 그들 자신뿐만 아니라 그들이 사랑하는 사람에게도 죽음을 의미합니다. 이것은 잔혹한 운명과의 싸움의 이야기로 희망을 찾는 것은 인간의 본성이지만 전망은 어둡습니다.
현립 오아라이 여학원 전차도 팀은 전국 고교 전차도 대회 우승 기념으로 열린 2:2 팀 익시비전 경기에 출전, 치하탄 학원과 팀을 맺어 프라우다 고교& 세인트 글로리아나 여학원 연합과 시합한다. 플래그 차량을 포함한 세인트 글로리아나 전차 4대를 골프장 벙커 쪽으로 몰아넣고 압박함과 동시에 프라우다/세인트 글로리아나의 크루세이더 소대가 지원을 오지 못하도록 언덕에 수비진을 배치하는 전략이 잘먹혀 초반엔 상당한 이득을 보나, 전통대로 돌격하자는 말과 함께 닥돌하는 치하탄 학원 전차 대부분이 격파를 당하며 진영이 붕괴된다. 이를 만회하기 위해 전장을 오아라이 항구로 옮겨 시가전을 벌여 치열한 승부를 펼치지만, 마지막 순간 미호의 전술을 눈치챈 다즐링이 카추샤와의 협공으로 4호를 격파하며 현립 오아라이 여학원 & 치하탄 학원팀은 패배한다.
