Shoma Mihara recebe uma mensagem do seu melhor amigo Atsushi, com quem não fala há muito tempo. "Queres vir ver um festival que eu descobri?" Ansioso com a ideia, Shoma parte para um festival Tanabata numa cidade-fantasma nas montanhas, onde acaba por conhecer uma rapariga chamada Shiori, que também está à procura de alguém. Kanna, a mestre de cerimônias, diz a Shoma: "Acredito que verás o Atsushi até o final do festival." E assim, para encontrá-lo, Shoma e Shiori ajudam a preparar o festival, mas acabam por se envolverem numa série de incidentes bizarros...
O grupo de corsários conhecido como Blue Steel continua sua missão de entregar projetos do Vibration Warhead Torpedo - uma arma que pode virar a maré da guerra a seu favor - para os Estados Unidos. No entanto, uma nova ameaça surge de seu inimigo, a esmagadora Frota da Névoa na forma de "O Conselho Estudantil.,"Este é um grupo de naves de guerra composto pelos Modelos Mentais restantes - os avatares humanóides das naves - que ainda precisam enfrentar o imprevisível capitão do Blue Steel, Gunzou Chihaya. À medida que o Blue Steel se aproxima de entender as origens da autoridade que controla o inimigo, O passado de Iona começa a revelar por que a guerra começou e sua razão para se aliar à humanidade.
Recapitulação da série de TV Aoki Hagane no Arpeggio: Ars Nova, com aproximadamente 40 minutos de material novo. Em 2039, o aquecimento global fez com que o nível do mar subisse e uma grande quantidade de território fosse perdida. Como que em resposta, um misterioso grupo de navios de guerra revestidos de névoa, "a Frota da Névoa", apareceu em todos os cantos do oceano, e começou a atacar naves humanas. Apesar da humanidade reunir todas as suas forças, eles foram totalmente derrotados pela força esmagadora da Névoa. Todas as rotas comerciais da humanidade foram bloqueadas pela Frota da Névoa, sua economia política foi destruída e a raça humana foi constantemente derrotada. Sete anos depois, o submarino da Frota da Névoa I- 401 aparece antes do cadete Gunzo Chihaya. A forma de vida humanóide que pilota o submarino, que deveria ser seu inimigo, está oferecendo seus serviços à humanidade.
