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Many engineers from around the world gather at the Interpol marine facility "Pacific Buoy" on Hachijo-jima, in the sea south of central Tokyo Prefecture coast, to witness the launch of a new system that connects all law enforcement camera systems around the world and enables facial recognition worldwide. Conan, along with his friends Kogoro, Ran, Agasa, Haibara, and the Detective Boys, also heads to the island with an invitation from Sonoko to see the whales. He receives a message from Subaru, who says that a Europol agent has been murdered in Germany by Gin. Perturbed, Conan sneaks onto the police ship led by Kuroda, which is bringing them to the island to protect the completion work, and tours the new facility, just in time for the Black Organization to kidnap a female engineer, seeking a piece of important data in her USB drive. A terrifying howl of screws is heard from the ocean as an unknown person approaches Haibara.
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Shibuya, Tóquio, está agitada com a temporada de Halloween. Um casamento está sendo realizado em Shibuya Hikarie, onde a detetive Miwako Sato, do Departamento de Polícia Metropolitana, está vestida com um vestido de noiva. Enquanto Conan e os outros convidados assistem, um agressor aparece de repente e o detetive Wataru Takagi, que estava tentando proteger Sato, fica ferido. Takagi sobreviveu e a situação foi resolvida, mas aos olhos de Sato, a imagem do ceifador que ela viu quando o detetive Matsuda, o homem por quem ela estava apaixonada, foi morto em uma série de atentados há três anos, coincidiu com Do Takagi.
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Em Tohsaka e Luviagelita, “Luvia” Edelfelt têm a tarefa de encontrar as sete “cartas de classe”, lendários artefatos medievais que contêm a essência vital dos espíritos heróicos. Para ajudá-los, eles recebem o poder de Ruby e Sapphire, dois Kaleidosticks poderosos e inteligentes que são capazes de se transformar em garotas mágicas e aumentar muito seus poderes. No entanto, Rin e Luvia se encontram em más condições, levando os Kaleidosticks a abandoná-los e buscar novos professores. É quando eles conhecem duas garotas, Illyasviel von Einzbern e Miyu, e as convencem a fazer um contrato. Com novos poderes e responsabilidades, Illya e Miyu agora terão que procurar as “Cartas de Classe”.
