La guerra contra el terror estalló, literalmente, el día en que Sarajevo fue destruido por un dispositivo nuclear hecho en casa. Las principales democracias se transformaron en estados de vigilancia total, y el mundo en desarrollo se ahogó bajo una ola de genocidios. El misterioso estadounidense John Paul parece estar detrás del colapso del sistema mundial, y le corresponde al agente de inteligencia Clavis Shepherd rastrear a John Paul a través de los restos de civilizaciones y encontrar el verdadero corazón de la oscuridad, un órgano genocida.
Lupin begins his heist by stealing a newly-discovered Japanese cultural treasure being transported to Germany. During his attempt to steal the treasure, however, he witnesses the always-ambitious Zenigata's supposed "death," a plan hatched by a ninja clan who are also after the treasure. Can Lupin and his friends prevent the ninja clan from obtaining what they seek?
