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Many engineers from around the world gather at the Interpol marine facility "Pacific Buoy" on Hachijo-jima, in the sea south of central Tokyo Prefecture coast, to witness the launch of a new system that connects all law enforcement camera systems around the world and enables facial recognition worldwide. Conan, along with his friends Kogoro, Ran, Agasa, Haibara, and the Detective Boys, also heads to the island with an invitation from Sonoko to see the whales. He receives a message from Subaru, who says that a Europol agent has been murdered in Germany by Gin. Perturbed, Conan sneaks onto the police ship led by Kuroda, which is bringing them to the island to protect the completion work, and tours the new facility, just in time for the Black Organization to kidnap a female engineer, seeking a piece of important data in her USB drive. A terrifying howl of screws is heard from the ocean as an unknown person approaches Haibara.
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Em Tohsaka e Luviagelita, “Luvia” Edelfelt têm a tarefa de encontrar as sete “cartas de classe”, lendários artefatos medievais que contêm a essência vital dos espíritos heróicos. Para ajudá-los, eles recebem o poder de Ruby e Sapphire, dois Kaleidosticks poderosos e inteligentes que são capazes de se transformar em garotas mágicas e aumentar muito seus poderes. No entanto, Rin e Luvia se encontram em más condições, levando os Kaleidosticks a abandoná-los e buscar novos professores. É quando eles conhecem duas garotas, Illyasviel von Einzbern e Miyu, e as convencem a fazer um contrato. Com novos poderes e responsabilidades, Illya e Miyu agora terão que procurar as “Cartas de Classe”.
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Em Tohsaka e Luviagelita, “Luvia” Edelfelt têm a tarefa de encontrar as sete “cartas de classe”, lendários artefatos medievais que contêm a essência vital dos espíritos heróicos. Para ajudá-los, eles recebem o poder de Ruby e Sapphire, dois Kaleidosticks poderosos e inteligentes que são capazes de se transformar em garotas mágicas e aumentar muito seus poderes. No entanto, Rin e Luvia se encontram em más condições, levando os Kaleidosticks a abandoná-los e buscar novos professores. É quando eles conhecem duas garotas, Illyasviel von Einzbern e Miyu, e as convencem a fazer um contrato. Com novos poderes e responsabilidades, Illya e Miyu agora terão que procurar as “Cartas de Classe”.
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É anunciado o primeiro supercondutor linear a vácuo do mundo com velocidade máxima de 1.000 km/h, que irá ser inaugurado na cerimônia de abertura do torneio WSG (World Sports Games) de Tóquio, que acontece uma vez a cada quatro anos. Enquanto chamam a atenção do mundo, altos executivos de grandes empresas são sequestrados do local da festa onde os patrocinadores do torneio WSG se reúnem. Conan procura uma solução e eventualmente encontra uma relação com os casos de raptos em série da WSG que ocorreu à 15 anos atrás em Boston, EUA.
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O detetive Conan viaja até Cingapura para investigar um horrível assassinato ligado a uma lendária pedra conhecida como o "Punho da Safira Azul" e para impedir Kaito Kid de colocar suas mãos na cobiçada joia.
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Após uma explosão repentina na ilha "Edge of Ocean" em Tóquio, Tōru Amuro, nome de código Zero, começa a investigar. Enquanto isso, o detetive Kogorō é preso como suspeito, então Conan Edogawa conduz a sua própria investigação para provar a sua inocência, mas Amuro metesse no seu caminho.
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Caso de atentado a bomba na TV Nichiuri no outono. A Satsuki Cup, que coroa o vencedor do Hyakunin Isshu do Japão, está sendo filmada dentro das instalações. O incidente resultou em uma grande comoção e, enquanto o prédio está queimando até as cinzas, as únicas pessoas que ficaram dentro são Hattori e Toyama Kazuha. Eles são resgatados na hora certa por Conan, que corre para o local. A identidade e os objetivos do homem-bomba são desconhecidos.
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Upon arriving at the Digital World after the "reboot", the digidestined are hunted by a new villain. Meanwhile, Sora is troubled by her partner digimon's indifference towards her.
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Two-hour remake of the original 1st episode, in celebration of the anime celebrating 20 years in broadcast. The special retells what happened on the day Shinichi was transformed into the body of a child. The special includes new scenes that weren't in the original manga or the first anime episode.