Num futuro distante, os seres humanos são atacados pela floresta devido ao fracasso da manipulação genética da mesma. Mas mesmo com as adversidades proporcionadas pelo ambiente em que vivem, Agito e outras pessoas conseguem viver felizes em tal cenário. Certo dia, Agito encontra Tula, uma jovem do passado que estava em hibernação suspensa. Ela tem o conhecimento necessário para fazer o mundo retornar ao que era antes, mas será isso uma coisa realmente boa?
O filme conta a história de Kimba adulto, casado com Léia e com os filhos Rune e Rukkio. Porém, as partes mais tristes do mangá acontecem nesse filme: Léia morre vítima de uma grave doença, e Kimba, se mata para salvar um humano em uma aventura num monte místico na selva. É considerado o filme mais trágico de todos os outros, mas apesar disso, fez sucesso. No Youtube, está disponível completo, e já conta com 1.000.000 visualizações. Há boatos que esse filme foi dublado no Brasil, e disponibilizado pela internet.
Dois anos após os acontecimentos no Galaxy Express 999, a terra tornou-se um campo de batalha. Tetsuro, mais velho e lutando contra o povo máquina, reingressa Maetel a bordo do GE999.
